Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC8A2Q9UPR5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC8A2Q9UPR5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC8A2Q9UPR5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms