Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNRF3Q9ULT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms