Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PNMA8BQ9ULN7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA8BQ9ULN7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms