Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTNNA3Q9UI47 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNA3Q9UI47 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNA3Q9UI47 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms