Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPN3Q9UHW5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPN3Q9UHW5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPN3Q9UHW5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms