Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP25Q9UHP3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms