Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF4Q9UHB7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF4Q9UHB7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms