Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATXN10Q9UBB4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATXN10Q9UBB4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN10Q9UBB4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms