Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
CYP39A1Q9NYL5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CYP39A1Q9NYL5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP39A1Q9NYL5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms