Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSHZ2Q9NRE2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSHZ2Q9NRE2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSHZ2Q9NRE2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSHZ2Q9NRE2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSHZ2Q9NRE2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms