Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCFQ9NPI8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCFQ9NPI8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms