Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FNDC4Q9H6D8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FNDC4Q9H6D8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms