Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TAF1DQ9H5J8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1DQ9H5J8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms