Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCL3Q9H2J4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDCL3Q9H2J4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDCL3Q9H2J4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms