Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX4Q9BYU1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX4Q9BYU1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms