Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1QTNF3Q9BXJ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms