Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms