Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms