Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
IFT140Q96RY7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 398.3 ms