Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00052Q96N35 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00052Q96N35 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms