Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EAF1Q96JC9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EAF1Q96JC9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms