Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ECHDC3Q96DC8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ECHDC3Q96DC8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms