Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP11CQ8NB49 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP11CQ8NB49 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP11CQ8NB49 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms