Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIML1Q8N9V2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms