Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-7■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 PHLDB1-217ENST00000530708 874 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-7■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 CCDC12-207ENST00000494655 793 ntTSL 220.18■□□□□ 0.822e-8■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 CCDC12-213ENST00000605875 380 ntTSL 517.47■□□□□ 0.392e-8■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 CCDC12-205ENST00000488069 897 ntTSL 217.39■□□□□ 0.372e-8■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 CCDC12-208ENST00000603885 560 ntTSL 317.39■□□□□ 0.372e-8■■■■□ 26.2
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AGGF1Q8N302 CCDC12-210ENST00000604181 550 ntTSL 415.79■□□□□ 0.122e-8■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-8■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 CCDC12-209ENST00000604164 399 ntTSL 311.15□□□□□ -0.622e-8■■■■□ 26.2
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AGGF1Q8N302 CCDC12-204ENST00000460035 572 ntTSL 210.71□□□□□ -0.692e-8■■■■□ 26.2
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AGGF1Q8N302 TMEM74B-202ENST00000429036 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.72■□□□□ 0.113e-8■■■■□ 26.2
AGGF1Q8N302 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.223e-8■■■■□ 26.2
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AGGF1Q8N302 SMG6-220ENST00000576218 902 ntTSL 314.77□□□□□ -0.052e-11■■■■□ 26.1
AGGF1Q8N302 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-11■■■■□ 26.1
AGGF1Q8N302 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.382e-11■■■■□ 26.1
AGGF1Q8N302 SMG6-213ENST00000573166 4236 ntTSL 1 (best)9.9□□□□□ -0.822e-11■■■■□ 26.1
AGGF1Q8N302 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.832e-11■■■■□ 26.1
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AGGF1Q8N302 PTPRM-205ENST00000577827 4640 ntTSL 211.12□□□□□ -0.638e-8■■■■□ 26
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AGGF1Q8N302 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.028e-8■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.098e-8■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.178e-8■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.238e-8■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.528e-8■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.24e-20■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 AL133352.1-202ENST00000527595 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.16■□□□□ 0.184e-20■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 AL133352.1-201ENST00000529568 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.08■□□□□ 0.164e-20■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.084e-20■■■■□ 26
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AGGF1Q8N302 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.354e-20■■■■□ 26
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AGGF1Q8N302 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.356e-7■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.446e-7■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 MYO18B-205ENST00000536101 8051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.576e-7■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 SAMD4A-207ENST00000555112 2287 ntTSL 1 (best)22.57■■□□□ 1.25e-10■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 ARID4B-208ENST00000466653 2315 ntTSL 218.13■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 26
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AGGF1Q8N302 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.245e-10■■■■□ 26
AGGF1Q8N302 ZFPM2-204ENST00000518180 596 ntTSL 45.72□□□□□ -1.491e-10■■■■□ 26
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AGGF1Q8N302 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.972e-6■■■■□ 25.8
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AGGF1Q8N302 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.174e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.154e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.074e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-220ENST00000634504 1847 ntTSL 214.62□□□□□ -0.074e-7■■■■□ 25.7
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AGGF1Q8N302 SAFB2-210ENST00000591310 722 ntTSL 313.21□□□□□ -0.294e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 ATRX-214ENST00000624166 4272 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.375e-8■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SAFB2-209ENST00000591123 836 ntTSL 511.84□□□□□ -0.514e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-13■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 KIF1B-213ENST00000635499 2098 ntTSL 511.16□□□□□ -0.622e-13■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-215ENST00000474353 2906 ntTSL 29.82□□□□□ -0.844e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.862e-13■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.874e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.964e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 ARHGEF12-206ENST00000528225 2647 ntTSL 58.94□□□□□ -0.984e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.982e-13■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.014e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.064e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.074e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.144e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.184e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.184e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.192e-13■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.194e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.224e-7■■■■□ 25.7
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