Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SVBPQ8N300 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVBPQ8N300 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms