Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYCP3Q8IZU3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCP3Q8IZU3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms