Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD4Q8IYR2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms