Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB8

SUPV3L1, ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPV3L1Q8IYB8 MLLT10-213ENST00000479634 165 ntTSL 1 (best)12.1□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 MLLT10-209ENST00000462999 344 ntTSL 1 (best)12.1□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 WAC-204ENST00000375646 2176 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.486e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 NF2-204ENST00000361166 1837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 RIDA-206ENST00000522791 884 ntTSL 211.83□□□□□ -0.526e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ANKRD54-209ENST00000464849 456 ntTSL 311.79□□□□□ -0.526e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SLC12A6-202ENST00000354181 4568 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 511.77□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 MLLT10-215ENST00000495130 744 ntTSL 311.66□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SEPT9-213ENST00000586433 569 ntTSL 411.63□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.566e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 311.57□□□□□ -0.566e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 MXD4-204ENST00000513380 624 ntTSL 511.5□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SEPT9-238ENST00000591472 555 ntTSL 411.46□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 GTF3C1-204ENST00000564664 933 ntTSL 511.39□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 TMEM183A-203ENST00000468449 763 ntTSL 311.38□□□□□ -0.597e-10■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 211.37□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 MLLT10-211ENST00000471315 319 ntTSL 311.17□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SEPT9-239ENST00000591704 749 ntTSL 211.09□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 TMEM165-203ENST00000506103 572 ntTSL 311.08□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 GTF3C1-209ENST00000568569 540 ntTSL 510.89□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 TMEM165-210ENST00000514904 1522 ntTSL 210.75□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 RAB5B-208ENST00000550283 665 ntTSL 310.65□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 510.64□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 VPS28-214ENST00000531032 573 ntTSL 1 (best)10.6□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 NF2-206ENST00000361676 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 410.55□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 RIDA-205ENST00000521560 761 ntTSL 210.55□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SLC7A8-201ENST00000316902 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SLC12A6-207ENST00000558667 3725 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CFAP43-202ENST00000357060 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CC2D1B-209ENST00000491136 4335 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CNOT1-210ENST00000567133 553 ntTSL 510.39□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 USP49-204ENST00000423567 752 ntTSL 210.35□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 C12orf57-202ENST00000537087 662 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 C12orf57-201ENST00000229281 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.766e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 NPHP3-203ENST00000465756 3852 ntTSL 510.19□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 TMEM165-212ENST00000608091 1567 ntTSL 310.16□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 IP6K1-209ENST00000613416 4806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 PRPSAP1-201ENST00000324684 1678 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.816e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 RAB5B-206ENST00000549505 3148 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 PRPSAP1-203ENST00000435555 916 ntTSL 59.86□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CIB2-205ENST00000557917 535 ntTSL 59.71□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 49.7□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 VPS28-204ENST00000526054 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ASXL1-204ENST00000470145 1073 ntTSL 59.56□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 GTF3C1-206ENST00000566779 645 ntTSL 39.55□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CIB2-207ENST00000559645 462 ntTSL 39.48□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ELMSAN1-211ENST00000486739 534 ntTSL 49.4□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 C5orf66-203ENST00000513931 474 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.916e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 49.19□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 RAB5B-205ENST00000549034 558 ntTSL 29.12□□□□□ -0.956e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 49.03□□□□□ -0.966e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SLC12A6-203ENST00000397702 4096 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -16e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -16e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -16e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 C12orf57-205ENST00000542222 640 ntTSL 28.63□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SLC7A8-202ENST00000339733 3066 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.066e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.086e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SPACA6-209ENST00000574072 480 ntTSL 38.31□□□□□ -1.086e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 GPR89B-207ENST00000490955 1906 ntTSL 28.25□□□□□ -1.096e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 BAZ2B-213ENST00000483316 6838 ntTSL 1 (best)8.14□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 MPHOSPH9-208ENST00000539024 3414 ntTSL 1 (best)8.12□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 AL139220.2-201ENST00000623351 482 ntTSL 37.93□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 NPHP3-204ENST00000469232 1616 ntTSL 27.81□□□□□ -1.166e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.176e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 AL139220.2-202ENST00000624869 142 ntTSL 57.6□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 GPR89B-206ENST00000488603 2701 ntTSL 27.57□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 NPHP3-208ENST00000490993 5197 ntTSL 57.36□□□□□ -1.236e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 CC2D1B-208ENST00000485966 532 ntTSL 37.21□□□□□ -1.266e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.266e-7■■■■■ 139.2
SUPV3L1Q8IYB8 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 139.2
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