Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC49Q8IUZ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC49Q8IUZ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms