Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OTOP1Q7RTM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms