Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CARMIL2Q6F5E8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
CARMIL2Q6F5E8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms