Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HES3Q5TGS1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HES3Q5TGS1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms