Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SNAPC4Q5SXM2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SNAPC4Q5SXM2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SNAPC4Q5SXM2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms