Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
FFAR4Q5NUL3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FFAR4Q5NUL3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FFAR4Q5NUL3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FFAR4Q5NUL3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FFAR4Q5NUL3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FFAR4Q5NUL3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FFAR4Q5NUL3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FFAR4Q5NUL3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FFAR4Q5NUL3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FFAR4Q5NUL3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FFAR4Q5NUL3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms