Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COLEC12Q5KU26 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COLEC12Q5KU26 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COLEC12Q5KU26 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms