Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW2

NHSL2, NHS-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL2Q5HYW2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NHSL2Q5HYW2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHSL2Q5HYW2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms