Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C5orf47Q569G3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C5orf47Q569G3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C5orf47Q569G3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C5orf47Q569G3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C5orf47Q569G3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C5orf47Q569G3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms