Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HS1BP3Q53T59 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HS1BP3Q53T59 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HS1BP3Q53T59 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HS1BP3Q53T59 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HS1BP3Q53T59 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms