Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFKFB4Q16877 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PFKFB4Q16877 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms