Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.026e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.026e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NEK8-203ENST00000579060 647 ntTSL 315.13■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PLEKHA7-204ENST00000525177 673 ntTSL 215.11■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.017e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.016e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.016e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GTF2A2-207ENST00000480768 1278 ntTSL 214.97□□□□□ -0.016e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.026e-11■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AKT1-209ENST00000554585 858 ntTSL 314.94□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TRMT1-212ENST00000588746 562 ntTSL 414.92□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TRMT1-216ENST00000591717 582 ntTSL 414.91□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2G2-204ENST00000477954 1034 ntTSL 314.91□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TM6SF2-205ENST00000591001 1768 ntTSL 214.9□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RAB11FIP5-203ENST00000479196 605 ntTSL 314.86□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PNPLA7-204ENST00000469998 4150 ntTSL 214.82□□□□□ -0.046e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZBTB17-203ENST00000440560 731 ntTSL 314.82□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.046e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZW10-202ENST00000535142 2735 ntTSL 214.75□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CNN2-210ENST00000569352 731 ntTSL 514.7□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.067e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DDX49-204ENST00000595858 1882 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SPATA20-203ENST00000502911 879 ntTSL 514.64□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PLEKHA7-206ENST00000525781 2391 ntTSL 214.61□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PSMC4-204ENST00000596386 929 ntTSL 214.59□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DDX49-206ENST00000598277 771 ntTSL 214.59□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NFKBID-209ENST00000591730 844 ntTSL 514.56□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DDX49-208ENST00000599156 633 ntTSL 514.52□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IRF3-211ENST00000596644 550 ntTSL 214.46□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CNN2-204ENST00000562075 623 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RBM33-206ENST00000392761 2934 ntTSL 214.44□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MAP3K3-204ENST00000577597 2024 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COASY-207ENST00000587214 539 ntTSL 414.4□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AKT1-219ENST00000610370 3187 ntTSL 214.38□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MICALL2-210ENST00000482839 852 ntTSL 214.38□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GTF2A2-201ENST00000267869 518 ntTSL 314.26□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PKD1-236ENST00000568796 447 ntTSL 314.23□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ARL4A-206ENST00000439721 845 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TRMT1-206ENST00000586224 543 ntTSL 314.22□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TCF3-211ENST00000587425 629 ntTSL 214.15□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 THTPA-205ENST00000555446 571 ntTSL 214.14□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SUGP1-214ENST00000592188 2029 ntTSL 214.12□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MRPS24-204ENST00000467084 729 ntTSL 214.06□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WDR97-203ENST00000528691 4491 ntTSL 214.05□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.176e-11■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.176e-11■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 CNN2-203ENST00000562015 563 ntTSL 413.98□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 HMGXB4-204ENST00000455359 1325 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.177e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM14C-203ENST00000467415 899 ntTSL 313.97□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM14C-202ENST00000466421 472 ntTSL 213.93□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MICALL2-213ENST00000490608 631 ntTSL 213.92□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MICAL3-207ENST00000461307 5981 ntTSL 513.9□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SLC23A1-203ENST00000502863 583 ntTSL 313.86□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SPOUT1-205ENST00000480366 661 ntTSL 213.8□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DCTD-208ENST00000507631 879 ntTSL 1 (best)13.7□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.226e-11■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 FBF1-202ENST00000585990 4481 ntTSL 213.59□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 GTF2A2-210ENST00000559706 382 ntTSL 213.54□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 WDR97-202ENST00000525150 4311 ntTSL 213.54□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.246e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 HMGXB4-206ENST00000466438 575 ntTSL 313.51□□□□□ -0.257e-13■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 IRF3-224ENST00000599680 472 ntTSL 313.51□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PRKD2-208ENST00000597390 1367 ntTSL 1 (best)13.49□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 DNMT1-204ENST00000585843 911 ntTSL 313.45□□□□□ -0.266e-11■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.286e-11■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 47.1
EFTUD2Q15029 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 47.1
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