Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKAP5Q14008 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP5Q14008 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP5Q14008 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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