Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MKRN4PQ13434 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MKRN4PQ13434 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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