Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XRCC4Q13426 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC4Q13426 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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