Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX4Q12846 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX4Q12846 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX4Q12846 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
STX4Q12846 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STX4Q12846 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STX4Q12846 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
STX4Q12846 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STX4Q12846 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STX4Q12846 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STX4Q12846 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
STX4Q12846 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
STX4Q12846 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
STX4Q12846 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
STX4Q12846 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STX4Q12846 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STX4Q12846 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STX4Q12846 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STX4Q12846 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
STX4Q12846 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
STX4Q12846 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
STX4Q12846 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
STX4Q12846 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
STX4Q12846 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21■□□□□ 0.95
STX4Q12846 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STX4Q12846 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STX4Q12846 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
STX4Q12846 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STX4Q12846 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
STX4Q12846 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
STX4Q12846 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STX4Q12846 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
STX4Q12846 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STX4Q12846 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STX4Q12846 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
STX4Q12846 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
STX4Q12846 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
STX4Q12846 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STX4Q12846 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STX4Q12846 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
STX4Q12846 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
STX4Q12846 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
STX4Q12846 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
STX4Q12846 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms