Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 SPT23YKL020C 3249 nt3.79□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 HMLALPHA1YCL066W 528 nt3.79□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 MATALPHA1YCR040W 528 nt3.79□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 SPC19YDR201W 498 nt3.79□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt3.79□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 AAD6YFL056C 639 nt3.79□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 YRA2YKL214C 612 nt3.79□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 YMR130WYMR130W 909 nt3.79□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 YNL228WYNL228W 777 nt3.79□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 YNL296WYNL296W 315 nt3.79□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 SRV2YNL138W 1581 nt3.79□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 YGL088WYGL088W 366 nt3.78□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 ADD66YKL206C 804 nt3.78□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 FMP46YKR049C 402 nt3.78□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 YPT53YNL093W 663 nt3.78□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 RPL18BYNL301C 561 nt3.78□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 CHD1YER164W 4407 nt3.78□□□□□ -1.8
NEJ1Q06148 NTH1YDR001C 2256 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 IXR1YKL032C 1794 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 CDC10YCR002C 969 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 PTC1YDL006W 846 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 UPS3YDR185C 540 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 AI5_BETAQ0075 1065 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 COX4YGL187C 468 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 SAE3YHR079C-A 276 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YHR140WYHR140W 720 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 EFB1YAL003W 621 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YLR156WYLR156W 345 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YLR159WYLR159W 345 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YLR161WYLR161W 345 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 RPS19AYOL121C 435 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 ECM23YPL021W 564 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 IDI1YPL117C 867 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 TDA6YPR157W 1404 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 ATM1YMR301C 2073 nt3.77□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 CEG1YGL130W 1380 nt3.76□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 PRP40YKL012W 1752 nt3.76□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 PHM7YOL084W 2976 nt3.76□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 RPP1AYDL081C 321 nt3.76□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 RPC53YDL150W 1269 nt3.76□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 RPS13YDR064W 456 nt3.76□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YER076CYER076C 909 nt3.76□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 MHO1YJR008W 1017 nt3.76□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.76□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt3.76□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 CBP1YJL209W 1965 nt3.75□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 SRP40YKR092C 1221 nt3.75□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 SWC7YLR385C 399 nt3.75□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 AST1YBL069W 1290 nt3.75□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 MRM1YOR201C 1239 nt3.75□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 GLN4YOR168W 2430 nt3.75□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YER077CYER077C 2067 nt3.75□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 ZRC1YMR243C 1329 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 TRM11YOL124C 1302 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 SPR28YDR218C 1272 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 RRP45YDR280W 918 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YGL108CYGL108C 423 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 RTA1YGR213C 954 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YKL169CYKL169C 384 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 MTF1YMR228W 1026 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 URE2YNL229C 1065 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YBR016WYBR016W 387 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 ICY2YPL250C 411 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 GRS2YPR081C 1857 nt3.74□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 VPS45YGL095C 1734 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 PMT4YJR143C 2289 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 SUL2YLR092W 2682 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 MNL1YHR204W 2391 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 IDS2YJL146W 1410 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 SPR6YER115C 576 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YGL188CYGL188C 174 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 ATG33YLR356W 594 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 ELC1YPL046C 300 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 TRK1YJL129C 3708 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 SWH1YAR042W 3567 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 LDB17YDL146W 1476 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 AVT7YIL088C 1473 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 RCM1YNL022C 1473 nt3.73□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 KIP3YGL216W 2418 nt3.72□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 ALG9YNL219C 1668 nt3.72□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YER034WYER034W 558 nt3.72□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt3.72□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 MED4YOR174W 855 nt3.72□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 GAC1YOR178C 2382 nt3.71□□□□□ -1.81
NEJ1Q06148 UBP6YFR010W 1500 nt3.71□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 PPZ1YML016C 2079 nt3.71□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 REC104YHR157W 549 nt3.71□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 IDP2YLR174W 1239 nt3.71□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 ASC1YMR116C 960 nt3.71□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 CUS2YNL286W 858 nt3.71□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 RRP40YOL142W 723 nt3.71□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 MGR2YPL098C 342 nt3.71□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 FMP30YPL103C 1407 nt3.7□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 FRA2YGL220W 363 nt3.7□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 YIL028WYIL028W 399 nt3.7□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 SOP4YJL192C 705 nt3.7□□□□□ -1.82
NEJ1Q06148 CNB1YKL190W 528 nt3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms