Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
IRX4P78413 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX4P78413 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX4P78413 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX4P78413 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX4P78413 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX4P78413 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX4P78413 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX4P78413 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX4P78413 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX4P78413 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRX4P78413 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX4P78413 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX4P78413 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX4P78413 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX4P78413 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX4P78413 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX4P78413 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX4P78413 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX4P78413 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX4P78413 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRX4P78413 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRX4P78413 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX4P78413 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX4P78413 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX4P78413 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX4P78413 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX4P78413 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX4P78413 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX4P78413 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX4P78413 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX4P78413 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX4P78413 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX4P78413 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX4P78413 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX4P78413 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX4P78413 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX4P78413 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX4P78413 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX4P78413 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX4P78413 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX4P78413 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX4P78413 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX4P78413 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX4P78413 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX4P78413 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX4P78413 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX4P78413 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX4P78413 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX4P78413 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX4P78413 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX4P78413 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX4P78413 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX4P78413 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX4P78413 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX4P78413 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX4P78413 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX4P78413 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX4P78413 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX4P78413 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX4P78413 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX4P78413 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX4P78413 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX4P78413 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX4P78413 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX4P78413 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX4P78413 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX4P78413 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX4P78413 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX4P78413 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX4P78413 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX4P78413 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX4P78413 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX4P78413 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX4P78413 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX4P78413 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX4P78413 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX4P78413 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX4P78413 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX4P78413 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX4P78413 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX4P78413 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX4P78413 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX4P78413 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX4P78413 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX4P78413 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX4P78413 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX4P78413 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX4P78413 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX4P78413 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX4P78413 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX4P78413 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms