Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC6P62333 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC6P62333 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms