Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A2P50993 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP1A2P50993 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP1A2P50993 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms