Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRB2P47870 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABRB2P47870 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms